La Oficina de la OIM en Panamá desempeña sus funciones bajo la orientación estratégica y operativa de la Oficina Regional de la OIM para las Américas, ubicada en la Ciudad de Panamá.

La Oficina de la OIM en Panamá implementa proyectos fundamentales relacionados con salvar vidas y proteger a personas en movimiento, impulsar soluciones a los desplazamientos y facilitar vías de migración regular. La Oficina de la OIM en Panamá apoya al Gobierno de Panamá en la gestión migratoria, integración, el fortalecimiento de las capacidades de instituciones de respuesta a situaciones de emergencia y la interacción con los organismos del Sistema de las Naciones Unidas, con el propósito de abordar la migración de manera segura, ordenada y digna.

La Oficina de la OIM en Panamá también es una Oficina País con funciones de coordinación, principalmente con la Oficina de la OIM en Cuba.

Además, la OIM tiene en Panamá la sede de uno de sus dos Centros Administrativos. Desde su inauguración en 2007, sus oficinas están ubicadas en Clayton y forma parte de la comunidad de usuarios de la Ciudad del Saber. El Centro Administrativo de Panamá (PAC por sus siglas en inglés) apoya a los Estados Miembros en el hemisferio occidental y a escala mundial. Los servicios que proporciona están relacionados con los recursos humanos, la capacitación, los seguros médicos y de salud, los servicios jurídicos, la contabilidad y las finanzas, la información, la tecnología y las comunicaciones, la seguridad, auditoría interna y el apoyo para situaciones de emergencia y consecutivas a las crisis.